Biomedical Computation

MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.303 C 0.183 G 0.209 T 0.306 

MOTIF crp
letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 17 E= 4.1e-009 
 0.000000  0.176471  0.000000  0.823529 
 0.000000  0.058824  0.647059  0.294118 
 0.000000  0.058824  0.000000  0.941176 
 0.176471  0.000000  0.764706  0.058824 
 0.823529  0.058824  0.000000  0.117647 
 0.294118  0.176471  0.176471  0.352941 
 0.294118  0.352941  0.235294  0.117647 
 0.117647  0.235294  0.352941  0.294118 
 0.529412  0.000000  0.176471  0.294118 
 0.058824  0.235294  0.588235  0.117647 
 0.176471  0.235294  0.294118  0.294118 
 0.000000  0.058824  0.117647  0.823529 
 0.058824  0.882353  0.000000  0.058824 
 0.764706  0.000000  0.176471  0.058824 
 0.058824  0.882353  0.000000  0.058824 
 0.823529  0.058824  0.058824  0.058824 
 0.176471  0.411765  0.058824  0.352941 
 0.411765  0.000000  0.000000  0.588235 
 0.352941  0.058824  0.000000  0.588235 

MOTIF lexA
letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 14 E= 3.2e-035 
 0.214286  0.000000  0.000000  0.785714 
 0.857143  0.000000  0.071429  0.071429 
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000 
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000 
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000 
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000 
 0.857143  0.000000  0.071429  0.071429 
 0.000000  0.071429  0.000000  0.928571 
 0.857143  0.000000  0.071429  0.071429 
 0.142857  0.000000  0.000000  0.857143 
 0.571429  0.071429  0.214286  0.142857 
 0.285714  0.285714  0.000000  0.428571 
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000 
 0.285714  0.214286  0.000000  0.500000 
 0.428571  0.500000  0.000000  0.071429 
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000 
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000 
 0.000000  0.000000  0.785714  0.214286